Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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