Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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