Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMGN3Q15651 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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