Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms