Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3A1Q15459 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3A1Q15459 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3A1Q15459 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3A1Q15459 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3A1Q15459 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3A1Q15459 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3A1Q15459 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3A1Q15459 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SF3A1Q15459 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SF3A1Q15459 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SF3A1Q15459 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SF3A1Q15459 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SF3A1Q15459 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SF3A1Q15459 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SF3A1Q15459 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SF3A1Q15459 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SF3A1Q15459 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SF3A1Q15459 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SF3A1Q15459 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SF3A1Q15459 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SF3A1Q15459 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SF3A1Q15459 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
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