Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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CYTH1Q15438 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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CYTH1Q15438 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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CYTH1Q15438 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
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CYTH1Q15438 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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CYTH1Q15438 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
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CYTH1Q15438 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CYTH1Q15438 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CYTH1Q15438 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CYTH1Q15438 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CYTH1Q15438 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYTH1Q15438 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYTH1Q15438 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYTH1Q15438 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYTH1Q15438 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYTH1Q15438 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYTH1Q15438 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYTH1Q15438 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYTH1Q15438 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYTH1Q15438 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYTH1Q15438 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYTH1Q15438 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYTH1Q15438 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYTH1Q15438 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYTH1Q15438 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYTH1Q15438 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYTH1Q15438 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYTH1Q15438 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYTH1Q15438 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYTH1Q15438 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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