Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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