Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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