Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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