Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IKBKEQ14164 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IKBKEQ14164 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IKBKEQ14164 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKEQ14164 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKEQ14164 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKEQ14164 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKEQ14164 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKEQ14164 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKEQ14164 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKBKEQ14164 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms