Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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