Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
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