Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGB1Q14028 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
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