Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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