Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX3Q13761 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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