Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FHL3Q13643 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms