Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF5Q13568 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
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