Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEUROD1Q13562 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms