Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAPPAQ13219 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PAPPAQ13219 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms