Protein–RNA interactions for Protein: Q13217

DNAJC3, DnaJ homolog subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC3Q13217 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DNAJC3Q13217 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DNAJC3Q13217 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms