Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.922e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 SLC39A14-209ENST00000520644 377 ntTSL 520.05■□□□□ 0.82e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 MYL5-203ENST00000503300 1780 ntTSL 219.67■□□□□ 0.742e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 PIK3CA-204ENST00000477735 245 ntTSL 419.43■□□□□ 0.72e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 SART1-204ENST00000529532 1471 ntTSL 218.99■□□□□ 0.632e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.632e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 VEZF1-203ENST00000583932 825 ntTSL 518.24■□□□□ 0.512e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 SLC39A14-212ENST00000524285 570 ntTSL 417.88■□□□□ 0.452e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.442e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.382e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.248e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 BCL9L-205ENST00000532899 611 ntTSL 516.56■□□□□ 0.245e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 SLC9A3R2-209ENST00000567504 578 ntTSL 316.45■□□□□ 0.222e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.152e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.132e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.092e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.015e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 MYL5-209ENST00000513662 731 ntTSL 514.96□□□□□ -0.012e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.042e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 ZBTB44-203ENST00000445008 3848 ntTSL 1 (best)14.1□□□□□ -0.158e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 SLC38A6-210ENST00000527591 1689 ntTSL 1 (best)13.99□□□□□ -0.172e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.192e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.232e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.388e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 DNMT1-214ENST00000588118 973 ntTSL 512.65□□□□□ -0.382e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.392e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.412e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 DNMT1-228ENST00000592705 5215 ntTSL 1 (best)12.35□□□□□ -0.432e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.492e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.52e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 MYL5-201ENST00000400159 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.542e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 ARID1B-209ENST00000494260 696 ntTSL 311.51□□□□□ -0.572e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 SLC39A14-203ENST00000359741 4641 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.592e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 MYL5-207ENST00000507804 829 ntTSL 311.25□□□□□ -0.612e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 DNMT1-211ENST00000586988 711 ntTSL 511.17□□□□□ -0.622e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 ARID1B-225ENST00000637532 445 ntTSL 510.96□□□□□ -0.652e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 ZBTB44-205ENST00000525842 9315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.698e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 PAX8-AS1-213ENST00000609210 1328 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.952e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 MYL5-205ENST00000505477 584 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.012e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 ANKFY1-209ENST00000574367 5033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.042e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.152e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 ARID1B-217ENST00000636607 406 ntTSL 37.82□□□□□ -1.162e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 AL162231.2-201ENST00000434627 665 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.172e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 OAT-208ENST00000539214 1864 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.262e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 ARID1B-213ENST00000636205 824 ntTSL 27.07□□□□□ -1.282e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.352e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 ANKFY1-205ENST00000572412 3352 ntTSL 26.52□□□□□ -1.372e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.372e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 SLC38A6-205ENST00000524402 768 ntTSL 56.46□□□□□ -1.382e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 PAX8-AS1-218ENST00000623031 442 ntTSL 56.24□□□□□ -1.412e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 SMARCC1-204ENST00000462198 785 ntTSL 26.24□□□□□ -1.412e-9■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 PIK3CA-203ENST00000468036 620 ntTSL 36.22□□□□□ -1.412e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 SLC38A6-208ENST00000526105 580 ntTSL 35.68□□□□□ -1.52e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 DNMT1-210ENST00000586800 583 ntTSL 35.67□□□□□ -1.52e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.572e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 SLC38A6-211ENST00000528350 555 ntTSL 44.3□□□□□ -1.722e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 SLC38A6-215ENST00000533744 583 ntTSL 53.89□□□□□ -1.792e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 DNMT1-226ENST00000592054 591 ntTSL 43.69□□□□□ -1.822e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 OAT-204ENST00000476917 646 ntTSL 33.39□□□□□ -1.872e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.982e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.381e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.192e-6■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.352e-6■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.522e-6■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 SEC14L1-201ENST00000392476 2957 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 SETD5-203ENST00000402198 6827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.753e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.163e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 ARID4B-208ENST00000466653 2315 ntTSL 216.39■□□□□ 0.212e-6■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 ARID4B-204ENST00000418304 1759 ntTSL 516.27■□□□□ 0.22e-6■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.654e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.614e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.414e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 CDK13-206ENST00000611390 2222 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.614e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 AC087235.1-201ENST00000538297 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.712e-6■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 CDK13-205ENST00000484589 2111 ntTSL 1 (best)8.13□□□□□ -1.114e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.245e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.175e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.975e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.955e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 CDC16-201ENST00000252457 2034 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.575e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 CDC16-205ENST00000375308 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.575e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 CDC16-208ENST00000484907 1038 ntTSL 39.82□□□□□ -0.845e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.35e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 AL591806.3-202ENST00000470694 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 219.85■□□□□ 0.773e-6■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 F11R-201ENST00000335772 571 ntTSL 414.64□□□□□ -0.073e-6■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 F11R-205ENST00000602966 558 ntTSL 414.64□□□□□ -0.073e-6■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.263e-6■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.353e-6■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 CARM1-209ENST00000590699 2240 ntTSL 526.2■■□□□ 1.785e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.395e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.845e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 CARM1-205ENST00000586508 1050 ntTSL 216.94■□□□□ 0.35e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 CARM1-204ENST00000586298 674 ntTSL 515.44■□□□□ 0.065e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 CARM1-203ENST00000586221 2766 ntTSL 1 (best)14.89□□□□□ -0.035e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.475e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 FRRS1-201ENST00000287474 2678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.15e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.256e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.076e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.046e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 CLPTM1L-214ENST00000513250 567 ntTSL 314.97□□□□□ -0.016e-7■■■■□ 23.8
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