Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms