Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRDM2Q13029 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms