Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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