Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FOXD4Q12950 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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