Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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PTPRJQ12913 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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PTPRJQ12913 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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PTPRJQ12913 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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PTPRJQ12913 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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PTPRJQ12913 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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PTPRJQ12913 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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PTPRJQ12913 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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PTPRJQ12913 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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PTPRJQ12913 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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PTPRJQ12913 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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PTPRJQ12913 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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PTPRJQ12913 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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PTPRJQ12913 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
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