Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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KCNH2Q12809 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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KCNH2Q12809 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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KCNH2Q12809 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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KCNH2Q12809 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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KCNH2Q12809 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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KCNH2Q12809 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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KCNH2Q12809 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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