Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 YPS5YGL259W 498 nt2.25□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 LSO2YGR169C-A 279 nt2.25□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 IRC19YLL033W 693 nt2.25□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt2.25□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 SYM1YLR251W 594 nt2.25□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 RUF22RUF22 515 nt2.25□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 snR41snR41 95 nt2.25□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 IRC10YOL015W 1761 nt2.25□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.25□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 RPL27BYDR471W 411 nt2.24□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 BIG1YHR101C 1008 nt2.24□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 YJL007CYJL007C 315 nt2.24□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 YJR079WYJR079W 330 nt2.24□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 SIP18YMR175W 240 nt2.24□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 COX7YMR256C 183 nt2.24□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 MGA2YIR033W 3342 nt2.24□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.24□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 ATG9YDL149W 2994 nt2.24□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 CDC27YBL084C 2277 nt2.24□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 YJR098CYJR098C 1971 nt2.23□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 VPS52YDR484W 1926 nt2.23□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 SCH9YHR205W 2475 nt2.23□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.23□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 BI2Q0110 1272 nt2.23□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.23□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 HSK3YKL138C-A 210 nt2.23□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 YLR171WYLR171W 390 nt2.23□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 SEC22YLR268W 645 nt2.23□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 ASM4YDL088C 1587 nt2.23□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 MUD2YKL074C 1584 nt2.23□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 BUD2YKL092C 3315 nt2.22□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 STB4YMR019W 2850 nt2.22□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 TOR2YKL203C 7425 nt2.22□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 YGL069CYGL069C 465 nt2.22□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 RPC10YHR143W-A 213 nt2.22□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 ARP7YPR034W 1434 nt2.22□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 GRR1YJR090C 3456 nt2.22□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.21□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 RRF1YHR038W 693 nt2.21□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 YML108WYML108W 318 nt2.21□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 KAR3YPR141C 2190 nt2.2□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 TUS1YLR425W 3924 nt2.2□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 ECL1YGR146C 636 nt2.2□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 AIM29YKR074W 468 nt2.2□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 GPX2YBR244W 489 nt2.2□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 HCS1YKL017C 2052 nt2.2□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 RPH1YER169W 2391 nt2.2□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 INO80YGL150C 4470 nt2.19□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 NOT5YPR072W 1683 nt2.19□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 YDL041WYDL041W 354 nt2.19□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 RRT1YBL048W 312 nt2.19□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 DGR1YNL130C-A 147 nt2.19□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 SGD1YLR336C 2700 nt2.19□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 SET2YJL168C 2202 nt2.19□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 BRE1YDL074C 2103 nt2.18□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.18□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 YGR042WYGR042W 816 nt2.18□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.18□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 YPR177CYPR177C 372 nt2.18□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 SLM6YBR266C 453 nt2.18□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 SWT1YOR166C 1377 nt2.18□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 CFT2YLR115W 2580 nt2.18□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 FAB1YFR019W 6837 nt2.18□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 MYO4YAL029C 4416 nt2.18□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.17□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.17□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.17□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 SEC31YDL195W 3822 nt2.17□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 PPN1YDR452W 2025 nt2.17□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.17□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.17□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 YLR269CYLR269C 351 nt2.17□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 MNL2YLR057W 2550 nt2.17□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 snR79snR79 84 nt2.16□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 YKL202WYKL202W 582 nt2.16□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 CYB5YNL111C 363 nt2.16□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.16□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.16□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 snR54snR54 86 nt2.16□□□□□ -2.06
RTP1Q12751 YLR149CYLR149C 2193 nt2.15□□□□□ -2.07
RTP1Q12751 IES5YER092W 378 nt2.15□□□□□ -2.07
RTP1Q12751 TMA7YLR262C-A 195 nt2.15□□□□□ -2.07
RTP1Q12751 TIF11YMR260C 462 nt2.15□□□□□ -2.07
RTP1Q12751 YNL324WYNL324W 396 nt2.15□□□□□ -2.07
RTP1Q12751 TSC3YBR058C-A 243 nt2.15□□□□□ -2.07
RTP1Q12751 YPL238CYPL238C 390 nt2.15□□□□□ -2.07
RTP1Q12751 PLC1YPL268W 2610 nt2.15□□□□□ -2.07
RTP1Q12751 GDS1YOR355W 1569 nt2.15□□□□□ -2.07
RTP1Q12751 YDL118WYDL118W 381 nt2.14□□□□□ -2.07
RTP1Q12751 GCN2YDR283C 4980 nt2.14□□□□□ -2.07
RTP1Q12751 RNH70YGR276C 1662 nt2.14□□□□□ -2.07
RTP1Q12751 ELG1YOR144C 2376 nt2.14□□□□□ -2.07
RTP1Q12751 LYS9YNR050C 1341 nt2.14□□□□□ -2.07
RTP1Q12751 BTT1YDR252W 450 nt2.13□□□□□ -2.07
RTP1Q12751 YFL019CYFL019C 354 nt2.13□□□□□ -2.07
RTP1Q12751 YHR125WYHR125W 306 nt2.13□□□□□ -2.07
RTP1Q12751 PGA1YNL158W 597 nt2.13□□□□□ -2.07
RTP1Q12751 YBR224WYBR224W 516 nt2.13□□□□□ -2.07
RTP1Q12751 MSS11YMR164C 2277 nt2.12□□□□□ -2.07
RTP1Q12751 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 95.2 ms