Protein–RNA interactions for Protein: Q12398

HMS1, Probable transcription factor HMS1, yeastyeast

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Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMS1Q12398 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt1.81□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 CDC33YOL139C 642 nt1.81□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 snR13snR13 124 nt1.81□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 MSS18YPR134W 807 nt1.81□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 DFG16YOR030W 1860 nt1.8□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 PPN1YDR452W 2025 nt1.8□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 YER068C-AYER068C-A 432 nt1.8□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 YER121WYER121W 345 nt1.8□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 EMP24YGL200C 612 nt1.8□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 LSO2YGR169C-A 279 nt1.8□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.8□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 CRG1YHR209W 876 nt1.8□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 YHR210CYHR210C 1026 nt1.8□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 YJL007CYJL007C 315 nt1.8□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 LCL2YLR104W 396 nt1.8□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 TMA7YLR262C-A 195 nt1.8□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 YOR333CYOR333C 417 nt1.8□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 EGD1YPL037C 474 nt1.8□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 snR41snR41 95 nt1.8□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 RUD3YOR216C 1455 nt1.8□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 MZM1YDR493W 372 nt1.79□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 NFU1YKL040C 771 nt1.79□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.79□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt1.79□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 YFR016CYFR016C 3702 nt1.79□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 HSL1YKL101W 4557 nt1.78□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 RTT107YHR154W 3213 nt1.78□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 CDC50YCR094W 1176 nt1.78□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 YDR509WYDR509W 348 nt1.78□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 YPL205CYPL205C 345 nt1.78□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 LHS1YKL073W 2646 nt1.78□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 VMR1YHL035C 4779 nt1.78□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 snR79snR79 84 nt1.77□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 YDR286CYDR286C 345 nt1.77□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 VAR1Q0140 1197 nt1.77□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 YLR101CYLR101C 396 nt1.77□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.77□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 snR54snR54 86 nt1.77□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 IST2YBR086C 2841 nt1.77□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 CHC1YGL206C 4962 nt1.77□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 SPC72YAL047C 1869 nt1.77□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 LYS9YNR050C 1341 nt1.76□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 DAD4YDR320C-A 219 nt1.76□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 HSK3YKL138C-A 210 nt1.76□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 YLR053CYLR053C 327 nt1.76□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt1.76□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 TSC3YBR058C-A 243 nt1.76□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 PRM3YPL192C 402 nt1.76□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 YCL023CYCL023C 348 nt1.76□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.76□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 SSQ1YLR369W 1974 nt1.76□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 FKS1YLR342W 5631 nt1.75□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 YLR419WYLR419W 4308 nt1.75□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 VPS8YAL002W 3825 nt1.75□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 KAR3YPR141C 2190 nt1.75□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 YGL069CYGL069C 465 nt1.75□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 YHR125WYHR125W 306 nt1.75□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 NBL1YHR199C-A 222 nt1.75□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.75□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 YAR068WYAR068W 486 nt1.75□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 YBL012CYBL012C 402 nt1.75□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 UBC7YMR022W 498 nt1.75□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 TIF11YMR260C 462 nt1.75□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 SNC2YOR327C 348 nt1.75□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 YPR177CYPR177C 372 nt1.75□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 COX1Q0045 1605 nt1.75□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 GYP5YPL249C 2685 nt1.75□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 SIR4YDR227W 4077 nt1.75□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 GDS1YOR355W 1569 nt1.75□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 MNE1YOR350C 1992 nt1.74□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.74□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 CAJ1YER048C 1176 nt1.74□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 TMA22YJR014W 597 nt1.74□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 PDR8YLR266C 2106 nt1.74□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 YNL010WYNL010W 726 nt1.74□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 CDC27YBL084C 2277 nt1.74□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 NIC96YFR002W 2520 nt1.74□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 SET2YJL168C 2202 nt1.74□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.74□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 KAP123YER110C 3342 nt1.73□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 BUD2YKL092C 3315 nt1.73□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 IRC20YLR247C 4671 nt1.73□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.73□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 ECL1YGR146C 636 nt1.73□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 YBR032WYBR032W 303 nt1.72□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 YPR146CYPR146C 330 nt1.72□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 INO80YGL150C 4470 nt1.72□□□□□ -2.13
HMS1Q12398 YNL144CYNL144C 2223 nt1.71□□□□□ -2.14
HMS1Q12398 ATG9YDL149W 2994 nt1.71□□□□□ -2.14
HMS1Q12398 QCR7YDR529C 384 nt1.71□□□□□ -2.14
HMS1Q12398 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.71□□□□□ -2.14
HMS1Q12398 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt1.71□□□□□ -2.14
HMS1Q12398 ERP4YOR016C 624 nt1.71□□□□□ -2.14
HMS1Q12398 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.71□□□□□ -2.14
HMS1Q12398 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.71□□□□□ -2.14
HMS1Q12398 PLC1YPL268W 2610 nt1.7□□□□□ -2.14
HMS1Q12398 VPH1YOR270C 2523 nt1.7□□□□□ -2.14
HMS1Q12398 ATP17YDR377W 306 nt1.7□□□□□ -2.14
HMS1Q12398 YLR149CYLR149C 2193 nt1.7□□□□□ -2.14
HMS1Q12398 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt1.7□□□□□ -2.14
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