Protein–RNA interactions for Protein: Q12334

SCM3, Protein SCM3, yeastyeast

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SCM3Q12334 TOR2YKL203C 7425 nt2.01□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 CDC24YAL041W 2565 nt2.01□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 HSH155YMR288W 2916 nt2.01□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 PUT3YKL015W 2940 nt2□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 MXR1YER042W 555 nt2□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 COA4YLR218C 453 nt2□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 YAR068WYAR068W 486 nt2□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 NUP120YKL057C 3114 nt2□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 YCR043CYCR043C 384 nt1.99□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 YHR130CYHR130C 336 nt1.99□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 RPA34YJL148W 702 nt1.99□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 YPR146CYPR146C 330 nt1.99□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 GCN2YDR283C 4980 nt1.99□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 ZRG8YER033C 3231 nt1.99□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 DAS1YJL149W 1992 nt1.99□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 BRE1YDL074C 2103 nt1.99□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 SEC31YDL195W 3822 nt1.98□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 YGR045CYGR045C 363 nt1.98□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 RPS18BYML026C 441 nt1.98□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 TSC3YBR058C-A 243 nt1.98□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt1.98□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 YJR039WYJR039W 3366 nt1.98□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 SEC63YOR254C 1992 nt1.98□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 TMN3YER113C 2121 nt1.97□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 MSH6YDR097C 3729 nt1.97□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.97□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 HMLALPHA2YCL067C 633 nt1.97□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 MATALPHA2YCR039C 633 nt1.97□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 MBB1YJL199C 327 nt1.97□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 FCF2YLR051C 654 nt1.97□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 RPS22BYLR367W 393 nt1.97□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 TIF11YMR260C 462 nt1.97□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt1.97□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 COX1Q0045 1605 nt1.97□□□□□ -2.09
SCM3Q12334 PAU3YCR104W 375 nt1.96□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 YER084W-AYER084W-A 513 nt1.96□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 COX13YGL191W 390 nt1.96□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 YGR025WYGR025W 303 nt1.96□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 FYV7YLR068W 456 nt1.96□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 snR13snR13 124 nt1.96□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 YNL144CYNL144C 2223 nt1.96□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 YBR184WYBR184W 1572 nt1.96□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 DFG16YOR030W 1860 nt1.96□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 YDR250CYDR250C 276 nt1.95□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 ATP17YDR377W 306 nt1.95□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 RPS24AYER074W 408 nt1.95□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 RPF1YHR088W 888 nt1.95□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 YML108WYML108W 318 nt1.95□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 CMC2YBL059C-A 330 nt1.95□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 EGD1YPL037C 474 nt1.95□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 Q0017Q0017 162 nt1.95□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 SEY1YOR165W 2331 nt1.94□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 YCR001WYCR001W 315 nt1.94□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 YJR098CYJR098C 1971 nt1.94□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 HIR3YJR140C 4947 nt1.93□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 HUR1YGL168W 333 nt1.93□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 CRG1YHR209W 876 nt1.93□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt1.93□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt1.93□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt1.93□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt1.93□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt1.93□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt1.93□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.93□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 YLR269CYLR269C 351 nt1.93□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 CGI121YML036W 546 nt1.93□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 YSW1YBR148W 1830 nt1.93□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 SKP2YNL311C 2292 nt1.93□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 DOT6YER088C 2013 nt1.93□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 INO80YGL150C 4470 nt1.93□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 IRE1YHR079C 3348 nt1.92□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 SEF1YBL066C 3447 nt1.92□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 BPH1YCR032W 6504 nt1.92□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 UBR2YLR024C 5619 nt1.92□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 snR70snR70 164 nt1.92□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt1.92□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt1.92□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt1.92□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt1.92□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 QCR7YDR529C 384 nt1.92□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.92□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 LRE1YCL051W 1752 nt1.92□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 TFC8YPL007C 1767 nt1.91□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 NUP170YBL079W 4509 nt1.91□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.91□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 DNA2YHR164C 4569 nt1.91□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 VPS15YBR097W 4365 nt1.91□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 UTP21YLR409C 2820 nt1.9□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 YGR250CYGR250C 2346 nt1.9□□□□□ -2.1
SCM3Q12334 JIP5YPR169W 1479 nt1.9□□□□□ -2.11
SCM3Q12334 BI2Q0110 1272 nt1.9□□□□□ -2.11
SCM3Q12334 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1.9□□□□□ -2.11
SCM3Q12334 AIM29YKR074W 468 nt1.9□□□□□ -2.11
SCM3Q12334 YBL012CYBL012C 402 nt1.9□□□□□ -2.11
SCM3Q12334 PKH3YDR466W 2697 nt1.89□□□□□ -2.11
SCM3Q12334 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt1.89□□□□□ -2.11
SCM3Q12334 YHR125WYHR125W 306 nt1.89□□□□□ -2.11
SCM3Q12334 RPL42BYHR141C 321 nt1.89□□□□□ -2.11
SCM3Q12334 YHR210CYHR210C 1026 nt1.89□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 107.7 ms