Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 GPN3YLR243W 819 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG41Q12048 YBL062WYBL062W 381 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG41Q12048 YOR152CYOR152C 771 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG41Q12048 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt0.9□□□□□ -2.26
ATG41Q12048 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt0.9□□□□□ -2.26
ATG41Q12048 DOP1YDR141C 5097 nt0.9□□□□□ -2.26
ATG41Q12048 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt0.9□□□□□ -2.26
ATG41Q12048 snR59snR59 78 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 BNA7YDR428C 786 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 PKR1YMR123W 369 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 NOP15YNL110C 663 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 DGR2YKL121W 2559 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 YBR224WYBR224W 516 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 MDS3YGL197W 4464 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 MVP1YMR004W 1536 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 ROM2YLR371W 4071 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 AZF1YOR113W 2745 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 YDR115WYDR115W 318 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 FCF2YLR051C 654 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 DPB11YJL090C 2295 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 KIP1YBL063W 3336 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 MSN5YDR335W 3675 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 IRR1YIL026C 3453 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 MSH5YDL154W 2706 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 RTR2YDR066C 591 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 IRC2YDR112W 309 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 YMR324CYMR324C 243 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 YPL039WYPL039W 951 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 SHE4YOR035C 2370 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 DFG10YIL049W 762 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 SEC22YLR268W 645 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 CGI121YML036W 546 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 URA10YMR271C 684 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 RPS7BYNL096C 573 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 HHT1YBR010W 411 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 BUD3YCL014W 4911 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 YJR029WYJR029W 5268 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 PEP3YLR148W 2757 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 SMY1YKL079W 1971 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 NUP82YJL061W 2142 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 SNF5YBR289W 2718 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 YER038W-AYER038W-A 381 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 TDA2YER071C 381 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 YER158W-AYER158W-A 216 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 RNR4YGR180C 1038 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 FSH1YHR049W 732 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 ABM1YJR108W 372 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 TIM8YJR135W-A 264 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 YOR376WYOR376W 369 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 YPR063CYPR063C 423 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 SLS1YLR139C 1932 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 SGD1YLR336C 2700 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 YDL068WYDL068W 330 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 VMA7YGR020C 357 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 LSO2YGR169C-A 279 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 EMC5YIL027C 426 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 YJL119CYJL119C 324 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 ARV1YLR242C 966 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 YNL114CYNL114C 372 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 YOL106WYOL106W 354 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 YPL080CYPL080C 327 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 UBS1YBR165W 834 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG41Q12048 UFD2YDL190C 2886 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 SAG1YJR004C 1953 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 ACF4YJR083C 930 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 CTK3YML112W 891 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 OSH6YKR003W 1347 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 MSS11YMR164C 2277 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 NUP188YML103C 4968 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 KAR3YPR141C 2190 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 YDL211CYDL211C 1119 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 YER138W-AYER138W-A 105 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 LIN1YHR156C 1023 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 BRX1YOL077C 876 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 ERP4YOR016C 624 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 YOR364WYOR364W 369 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 YPR146CYPR146C 330 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 YJR098CYJR098C 1971 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 CMS1YLR003C 876 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 YLR217WYLR217W 324 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 FMP23YBR047W 528 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 YPR172WYPR172W 603 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 PAU24YBR301W 363 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 SEC5YDR166C 2916 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 MUK1YPL070W 1839 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 EAF1YDR359C 2949 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 REF2YDR195W 1602 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.8□□□□□ -2.28
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