Protein–RNA interactions for Protein: Q08957

AFT2, Iron-regulated transcriptional activator AFT2, yeastyeast

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AFT2Q08957 RLF2YPR018W 1821 nt2.76□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 KAP104YBR017C 2757 nt2.75□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 DAD4YDR320C-A 219 nt2.75□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 RPL29YFR032C-A 180 nt2.75□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.75□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 SWD3YBR175W 948 nt2.75□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 SLH1YGR271W 5904 nt2.74□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 TAF2YCR042C 4224 nt2.74□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 MDM32YOR147W 1869 nt2.74□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 RPS26BYER131W 360 nt2.74□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 YJR023CYJR023C 402 nt2.74□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 YKL111CYKL111C 336 nt2.74□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.74□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 PBS2YJL128C 2007 nt2.74□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 COG8YML071C 1824 nt2.74□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 PTP3YER075C 2787 nt2.74□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 COX1Q0045 1605 nt2.74□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 SOK2YMR016C 2358 nt2.74□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 DPB11YJL090C 2295 nt2.73□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 PEX5YDR244W 1839 nt2.73□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 ECM25YJL201W 1800 nt2.73□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 ADK1YDR226W 669 nt2.73□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 PAU2YEL049W 363 nt2.73□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 YIL102CYIL102C 306 nt2.73□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.73□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 ATP15YPL271W 189 nt2.73□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 SSP1YHR184W 1716 nt2.73□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 STE11YLR362W 2154 nt2.73□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 MSH4YFL003C 2637 nt2.72□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 CYR1YJL005W 6081 nt2.72□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.72□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 MES1YGR264C 2256 nt2.72□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 NMA111YNL123W 2994 nt2.72□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 MET6YER091C 2304 nt2.71□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 RSN1YMR266W 2862 nt2.71□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 YDL011CYDL011C 324 nt2.71□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 MZM1YDR493W 372 nt2.71□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 RPL37AYLR185W 267 nt2.71□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 HTB2YBL002W 396 nt2.71□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 LCL1YPL056C 306 nt2.71□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 VAS1YGR094W 3315 nt2.71□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 SKP2YNL311C 2292 nt2.71□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 FRE2YKL220C 2136 nt2.71□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt2.7□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 KHA1YJL094C 2622 nt2.7□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 PUF6YDR496C 1971 nt2.69□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 YDR061WYDR061W 1620 nt2.69□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 PSK1YAL017W 4071 nt2.69□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 CAF120YNL278W 3183 nt2.69□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 BFA1YJR053W 1725 nt2.69□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 MRP10YDL045W-A 288 nt2.69□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 YEL014CYEL014C 306 nt2.69□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 RPS24AYER074W 408 nt2.69□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 YNL010WYNL010W 726 nt2.69□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 YLR001CYLR001C 2589 nt2.69□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 FKS3YMR306W 5358 nt2.68□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.68□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 YHL042WYHL042W 453 nt2.67□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 TIM8YJR135W-A 264 nt2.67□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 PSY2YNL201C 2577 nt2.67□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 NUM1YDR150W 8247 nt2.66□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 PHO91YNR013C 2685 nt2.66□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 NAN1YPL126W 2691 nt2.66□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 NEW1YPL226W 3591 nt2.66□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 BOI1YBL085W 2943 nt2.66□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 MSB1YOR188W 3414 nt2.66□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 SRB8YCR081W 4284 nt2.66□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 VTC1YER072W 390 nt2.66□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.66□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 RPL32YBL092W 393 nt2.66□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt2.66□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 DSE4YNR067C 3354 nt2.65□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 RIF1YBR275C 5751 nt2.65□□□□□ -1.98
AFT2Q08957 YDR250CYDR250C 276 nt2.65□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 HPA3YEL066W 540 nt2.65□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 VPS55YJR044C 423 nt2.65□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 EMC6YLL014W 327 nt2.65□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 YBL053WYBL053W 375 nt2.65□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 MLH1YMR167W 2310 nt2.65□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 SVL3YPL032C 2478 nt2.65□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 ORC2YBR060C 1863 nt2.65□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 PHO2YDL106C 1680 nt2.64□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 OLI1Q0130 231 nt2.64□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 YLR053CYLR053C 327 nt2.64□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 SRB4YER022W 2064 nt2.64□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 TPS2YDR074W 2691 nt2.64□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 SGS1YMR190C 4344 nt2.63□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt2.63□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.63□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 CYB5YNL111C 363 nt2.63□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 SLN1YIL147C 3663 nt2.63□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 ALY1YKR021W 2748 nt2.63□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 BIT61YJL058C 1632 nt2.63□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 RIM20YOR275C 1986 nt2.63□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 NCE101YJL205C 162 nt2.62□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 YOR015WYOR015W 360 nt2.62□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 MDM20YOL076W 2391 nt2.62□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 CUL3YGR003W 2235 nt2.62□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 URB2YJR041C 3525 nt2.62□□□□□ -1.99
AFT2Q08957 RGR1YLR071C 3249 nt2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 65.3 ms