Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms