Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLEQ07864 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLEQ07864 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLEQ07864 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLEQ07864 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLEQ07864 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLEQ07864 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLEQ07864 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLEQ07864 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLEQ07864 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POLEQ07864 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLEQ07864 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLEQ07864 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLEQ07864 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLEQ07864 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLEQ07864 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLEQ07864 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLEQ07864 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLEQ07864 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLEQ07864 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLEQ07864 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLEQ07864 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLEQ07864 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLEQ07864 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLEQ07864 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POLEQ07864 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLEQ07864 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLEQ07864 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLEQ07864 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLEQ07864 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLEQ07864 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLEQ07864 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLEQ07864 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLEQ07864 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLEQ07864 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLEQ07864 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLEQ07864 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLEQ07864 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLEQ07864 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLEQ07864 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLEQ07864 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLEQ07864 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLEQ07864 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLEQ07864 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLEQ07864 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLEQ07864 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLEQ07864 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLEQ07864 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLEQ07864 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLEQ07864 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLEQ07864 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLEQ07864 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLEQ07864 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLEQ07864 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLEQ07864 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLEQ07864 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLEQ07864 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLEQ07864 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLEQ07864 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLEQ07864 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLEQ07864 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLEQ07864 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLEQ07864 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLEQ07864 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLEQ07864 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLEQ07864 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLEQ07864 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms