Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms