Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms