Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CD164Q04900 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CD164Q04900 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CD164Q04900 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CD164Q04900 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CD164Q04900 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CD164Q04900 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CD164Q04900 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CD164Q04900 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CD164Q04900 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CD164Q04900 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CD164Q04900 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CD164Q04900 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CD164Q04900 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CD164Q04900 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CD164Q04900 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CD164Q04900 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CD164Q04900 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CD164Q04900 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CD164Q04900 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CD164Q04900 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CD164Q04900 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CD164Q04900 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CD164Q04900 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CD164Q04900 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CD164Q04900 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CD164Q04900 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CD164Q04900 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CD164Q04900 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CD164Q04900 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CD164Q04900 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CD164Q04900 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CD164Q04900 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CD164Q04900 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CD164Q04900 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CD164Q04900 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CD164Q04900 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CD164Q04900 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CD164Q04900 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CD164Q04900 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CD164Q04900 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CD164Q04900 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CD164Q04900 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CD164Q04900 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CD164Q04900 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CD164Q04900 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CD164Q04900 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CD164Q04900 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CD164Q04900 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CD164Q04900 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CD164Q04900 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CD164Q04900 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CD164Q04900 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CD164Q04900 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CD164Q04900 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms