Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1Q04771 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACVR1Q04771 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms