Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms