Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms