Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1DQ01668 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms