Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms