Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms