Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN7AQ01118 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms