Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms