Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BEX3Q00994 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms