Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms