Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUCB2P80303 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms