Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIP4K2BP78356 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIP4K2BP78356 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIP4K2BP78356 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIP4K2BP78356 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIP4K2BP78356 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PIP4K2BP78356 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIP4K2BP78356 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIP4K2BP78356 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIP4K2BP78356 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIP4K2BP78356 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIP4K2BP78356 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIP4K2BP78356 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIP4K2BP78356 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIP4K2BP78356 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIP4K2BP78356 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PIP4K2BP78356 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIP4K2BP78356 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PIP4K2BP78356 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIP4K2BP78356 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PIP4K2BP78356 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIP4K2BP78356 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms