Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms